Na escolha de seu nome, a municipalidade homenageou a célebre batalha que se deu nas Colinas de Guararapes, em Pernambuco, e que é o marco da expulsão dos holandeses do Brasil. Quanto à história do município, sabe-se que se inicia em 1927, quando os irmãos Pinto de Oliveira, de Varginha, Minas Gerais, venderam suas terras, compreendidas entre os córregos Frutal e Jacaré, à Companhia Paulista de Colonização Ltda., que ao longo de toda a estrada Aguapeí-Tietê (construída em 1920), promovia loteamentos para a fixação de colonos, principalmente estrangeiros.

Assim, em 1928, formava-se um patrimônio, de nome Frutal, por causa do córrego que o limitava, e que logo se desenvolveria com a construção de uma estação da Noroeste, em 1930. Em 1937, Frutal se emancipa de Araçatuba; e, por força de lei estadual, do então Departamento das Municipalidades, seu nome logo seria alterado para Guararapes.

A palavra Guararapes (e apenas como curiosidade, já que o nome não tem nada a ver com qualquer característica do município, pois se trata de uma homenagem à Batalha de Guararapes, acontecida em Pernambuco, no século XVII, que opôs espanhóis, portugueses e brasileiros contra os invasores holandeses), vem do tupi, e duas hipóteses podem explicar sua origem: a primeira toma gûarará com o significado de tambor e supõe que era esse o nome original da serra em questão, visto que -pe quer dizer simplesmente “em” ou “para”. O s seria o plural, que se deu no aportuguesamento da palavra, já que a forma plural do tupi é igual à singular.

A segunda explicação, fornecida por índios guaranis contemporâneos, afirma que o significado do topônimo vem a ser o caminho do lobo, para gûará – lobo e r-apé – caminho.

Guararapes emancipou-se em 05 de janeiro de 1937.

Fonte: (livro) A origem dos nomes dos municípios paulistas, Enio Squeff e Helder Perri Ferreira, 2003, pg. 125.